Il passaggio della guerra tra il 1943 e il 1944, arrecò gravi danni a tutto l'abitato, comprese le due chiese di S. Maria della Rosa e di S. Nicola. Quest'ultima subì la distruzione di una metà della parete sinistra, con i vari affreschi che la decoravano e la perdita totale del pregevolissimo coro ligneo trecentesco, dovuta più che altro a vandalismo. I danni furono riparati per l'essenziale, ma purtroppo le strutture del nuovo tetto si deteriorarono rapidamente compromettendo il lavoro già fatto. Anche la chiesa principale subì vari danni, con perdite assai sensibili per quanto concerne decorazioni d'altari e pitture. [cfr. A. Pantoni, San Vittore del Lazio. Ricerche storiche e artistiche, Montecassino 2000]